中国医学科学院成立于1956年，北京协和医学院成立于1917年，中国医学科学院北京协和医学院自1957年起实行院校合一的管理体制，是我国最高医学研究机构和领衔医学教育机构。院校始终牢记初心使命，以引领我国医学科技教育发展和维护人民健康为己任，教育人才辈出，科研硕果累累，医疗领衔行业，为我国现代科学医学体系的建立和发展做出了重要贡献。

建立之初，北京协和医学院开创了我国八年制医学教育、高等护理教育、住院医师培训制度和现代公共卫生教育，取得了“北京猿人研究”“单体麻黄素提取”“黑热病研究”等一系列重要成果；中国医学科学院在脊髓灰质炎疫苗研发、全国控制和基本消灭麻风病、根治绒毛膜上皮癌化学疗法的创建与推广、我国抗生素自主研发和工业化生产等方面做出了创造性贡献。院校培养了包括张孝骞、张锡钧、钟惠澜、林巧稚等在内的55位医药卫生领域两院院士，为解放军总医院、北京医院、中国疾病预防控制中心、军事科学院军事医学研究院、首都医科大学、北京安贞医院等国内众多重要医学和卫生机构的建立提供了人才与技术支持。

目前，院校已发展成为拥有21个研究所、6家附属医院、10个学院、105个院外研发机构，集医教研产为一体的国家级综合性医学科学研究机构。院校现有两院院士24人、国家杰青56人，博士生导师1032名、硕士生导师1231名；拥有国家“双一流”建设学科5个，一级学科博士学位授权点9个，在教育部第五轮学科评估中有7个A类学科；拥有全国重点实验室11个、国家临床医学研究中心5个、其他国家级科研基地15个、省部级实验室71个等。院校直属北京协和医院、阜外医院、肿瘤医院、整形外科医院、血液病医院和皮肤病医院等6所医院，集医院、研究所和教学机构于一体，形成了国内领衔、国际先进的医疗与医学研究、教育体系。