山西医科大学的前身是山西医学传习所，1919年创建于古城并州。1932年改为私立山西川至医学专科学校。1940年更名为山西大学医学专修科。1946年升格为国立山西大学医学院。中华人民共和国成立后，学校步入崭新的发展时期。1953年独立建校，更名为山西医学院。1996年更名为山西医科大学。

学校是全国第三批、山西省首批博士学位授权单位，全国首批硕士学位授权单位，全国首批学士学位授权单位，教育部首批“卓越医生教育培养计划”试点单位，国家中西部高校基础能力建设工程支持高校。学校是新中国最早建立核医学专业的高校之一，是全国卫生系“老六所”之一、全国 18所高水平公共卫生学院建设高校之一，是首批教育部批准建立法医学专业的高校之一，是全国首批恢复儿科学本科专业的8所医学院校之一。学校获赠 2019年9月6日在天安门广场升起的国旗。“红石榴”工作室被中共中央、国务院授予“全国民族团结进步模范集体”。

经过106年的建设发展，学校已成为一所以医学为主，医工结合、医理结合、医文结合、医管结合，协调发展的医科大学，拥有以本科教育为主、本硕博多层次的完整人才培养体系，形成了“医理博精、德能高邃”校训、“献身、务实、团结、进取”校风和“求实精进、坚韧弘毅”的山医精神。

学校现有川至、迎泽、中都三个校区，占地总面积1422亩，建筑面积71万平方米。现有第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、第五临床医学院、基础医学院、公共卫生学院、药学院、法医学院、护理学院等40个教学机构，第一医院、第二医院、第三医院、第五医院、口腔医院等66个附属及教学医院，125个其他教学基地，4个山西省产教融合研究生联合培养基地。

学校现有教职医护员工7000余人，研究生导师2300余人，临床教师2200余人。拥有国家杰出青年科学基金获得者、国家优秀青年科学基金获得者、国家级有突出贡献专家、国家重点研发计划首席科学家、“新世纪百千万人才工程”国家级人选、教育部“新世纪优秀人才”等国家、省部级专家及高层次人才500余人，国家优秀教学团队等国家、省级教学团队24个。

学校现有1个国家重点学科——生理学。1个院士工作站——反向病原学研究中心徐建国院士工作站。2个教育部重点实验室——细胞生理学教育部重点实验室、煤炭环境致病与防治教育部重点实验室。1个省部共建协同创新中心——分子影像精准诊疗省部共建协同创新中心。1个国家卫生健康委重点实验室——尘肺病重点实验室。1个教育部医药基础研究创新中心——慢性肾脏病医药基础研究创新中心。1个国家原子能机构核技术研发中心——国家原子能机构核技术（核医学诊疗与转化）研发中心。联合建设1个公安部重点实验室——法庭毒物分析公安部重点实验室。3个国家级示范中心——临床技能实训中心、基础医学实验教学中心、临床教学培训示范中心。1个国家级创新创业学院。

学校现有6个进入ESI全球排名前1%的学科——临床医学、药理与毒理学、神经科学与行为学、生物学与生物化学、社会科学总论、化学。特种医学连续3年位列软科中国最好学科排名全国第一，入选中国顶尖学科；连续两年位列校友会中国一流学科排名全国第一，入选校友会世界高水平、中国顶尖学科。12个国家临床重点专科——骨科、护理、重症医学科、心血管内科、病理科、泌尿外科、肾脏内科、眼科、急诊医学科、老年病科、普通外科、风湿免疫科；34个国家临床重点专科建设项目；6个国家支持的山西省临床重点专科。各类省级科研平台85个。获批筹建精准诊疗山西省实验室。

学校现有5个一级学科设有博士后科研流动站——临床医学、公共卫生与预防医学、特种医学、基础医学、护理学。

6个一级学科博士学位授权点——基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、特种医学、护理学；2个博士专业学位授权点——临床医学、口腔医学；11个一级学科硕士学位授权点——基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、特种医学、护理学、生物医学工程、马克思主义理论、心理学；10个硕士专业学位授权点——临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学、医学技术、生物与医药、社会工作、应用心理、图书情报。学校现有12个国家一流本科专业建设点——临床医学、预防医学、药学、法医学、护理学、麻醉学、口腔医学、医学检验技术、基础医学、儿科学、临床药学、卫生检验与检疫。5个国家级特色专业建设点。临床医学（五年制）、临床医学（农村定向免费生）、护理专业为教育部首批国家“本科教学工程”地方高校本科专业综合改革试点专业。学校设有临床医学（五年制、“5+3”一体化）、预防医学、法医学、口腔医学、儿科学、医学影像学、麻醉学、护理学、精神医学、眼视光医学、药学等29个本科专业。

学校现有全日制在校生21829人，其中本科生14428人、硕士研究生6540人、博士研究生861人、国际学生350人。建校以来，学校培养了以徐福静、史书翰、王敏清、刘谦4位中央保健局负责人，全国首枚“白求恩奖章”获得者、“人民的好医生”赵雪芳，中国工程院院士徐建国、田志刚，南丁格尔奖章获得者杨辉、张颖惠等为代表的医药卫生专业人才15万余名。

学校科研发展势头良好。2024年，获批国家级项目71项，其中国家重大重点类项目6项。获批国家重点研发计划“常见多发病防治研究”重大专项，单项经费4000万元，达历史新高。获批各类省部级项目258项，开展横向合作课题75项。发表论文5463篇，其中SCI收录2755篇。与清华大学医学院、华大生命科学研究院等合作持续深化，开展合作以来，在国际高水平期刊产出一批高水平论文，其中《Nature》3篇、《Science》1篇，入选《2024年中国内地高校顶刊发文年鉴》顶刊成果TOP100高校。获山西省科学技术奖27项。获授权专利611项，软件著作权授权348项。

学校积极开展国际交流合作和国际学生教育。与17个国家的47所高校及相关教育科研机构建立了合作关系，加入中俄医科大学联盟等6个极具影响力的教育联盟，连续三年承办教育部“国际产学研用合作会议”。大力实施“青年骨干教师海外培养计划”与“博士研究生海外培养计划”，师生医护国际胜任力不断提升。